De rekening-courant is een rentedragende rekening die een agentschap aanhoudt bij het ministerie van Financiën. Deze rekening geeft de onderlinge financiële verhouding weer tussen een agentschap en het ministerie van Financiën. Op deze rekening worden o.a. de mutaties van de bankrekening(en) verwerkt. Dit is de enige rekening die, na saldoregulatie van de bankrekening(en), een saldo heeft.